Her doğum için olası komplikasyonlar vardır. Fakat ikiz gebelikler, tekil gebeliklere oranla daha zahmetli bir süreçtir. Pek çok anne adayı, tekil gebelik durumunda bile bir hayli sıkıntılı bir süreç yaşarken, ikiz bebek bekleyen anne adaylarının yaşayacağı zorluklar ve dikkat etmeleri gereken konular daha fazladır. İkiz gebelik, doktora daha sık giderek sürekli kontrol altında olmayı gerektirir. Bu durumdaki anne adayları doğum esnasında da bir takım sorunlarla karşı karşıya kalabilirler.

İkiz doğumlarda en fazla görünen sorun erken doğum yapma tehlikesidir. İkiz gebeliklerde gebelik süresi çoğunlukla otuz yedi hafta sürmektedir. Otuz yedinci haftadan sonra süreçte genellikle bir takım sıkıntılar ortaya çıkmaya başlar. Otuz yedinci haftada çoğu ikiz gebeliklerde erken doğum bulgularına rastlanır ve bu nedenle hastaneye yatırılır. İkiz bebeklerin otuz yedinci haftadan önce dünyaya gelmeleri ihtimali ise yüze yirmi beş ile yüzde kırk arasında değişir.

İkiz doğumlarda ortaya çıkan sorunlardan diğeri, doğumun normal doğum ya da sezeryan yöntemlerinin hangisi ile yapılacağı. Doktor anne adayına kendisinin ve bebeklerinin durumu ile ilgili gerekli olan tüm detaylı bilgiyi aktarır ancak doğumun ne şekilde yapılacağına kişi kendisi karar verir. Anne adayı normal doğum yapmayı tercih etmiş olsa da, doğum sırasında yaşanan bazı problemli durumlar nedeniyle sezeryana çevirme söz konusu olabilir.

Tüp bebek yöntemi ile gebe kalması sağlanmış bir anne adayının, normal yolla gebe kalmış bir anne adayına göre, sezeryanla doğum yapma olasılığı daha yüksek oluyor. Uzun süre bebek sahibi olabilmeyi arzu etmiş fakat olamamış, bunu ancak tüp bebek yöntemi ile başarmış olan çiftler, doğum sırasında herhangi bir riskle karşılaşmamak için genellikle sezeryanı tercih ediyorlar. Normal doğum tercih edilmiş olması halinde bile ikiz bebek doğumları çoğunlukla sezeryan ile sonuçlandırılıyor. Çünkü bu doğumlar tekil doğumlara oranla daha fazla risk taşıyorlar. Bu nedenle tüp bebek yöntemiyle gebe kalmış olan anne adayları genellikle sezeryanı tercih ediyorlar. Uzun çabalar sonucunda gebe kalabilmiş olan bu kişiler doğal olarak doğum esnasında yaşanabilecek sıkıntıları ve bebeği kaybetme riskini göze almak istemiyorlar.

Bazı durumlarda anne adayı normal doğum yapmak istese de, bu yolla ikiz doğumu çok tehlikeli olabilir. Normal yolla doğumu zorlaştıran en önemli neden bebeklerin anne karnında duruş biçimleridir. Anne karnındaki bebeklerin duruş şekilleri ultrason ile takip edilebilir. Bebeklerden birinin ya da her ikisinin de ters veya yatay duruyor olması normal doğumu güçleştiriyor. Bebeklerden önde olanı baş gelişli duruyorsa normal doğum mümkün olabiliyor. İlk bebek doğduktan sonra ikinci bebeğin pozisyonu doktor müdahalesi ile düzeltiliyor ve normal doğum gerçekleşmiş oluyor. Ancak ilk bebeğin ters durması halinde, baş takılması riski olabileceğinden sezeryan tercih ediliyor. Anne adaylarının, doktorlarının önerilerini dikkate alarak doğum şekline karar vermeleri uygun olur.