Hamilelik döneminde mikrodalga fırın kullanmak, yakınında bulunda ya da mikrodalga fırında pişirilen yiyecekleri yemek sakıncalı değildir. Mikrodalga fırınları kullanan gebelerde gelişen herhangi bir yan etki gösterilmemiştir.

Mikrodalga fırınlar non-iyonize mikrodalga radyasyon vasıtasıyla yiyecekleri ısıtırlar. Bu mikrodalga radyasyon yiyecek ve içecekler içerisinde absorbe olarak ısı enerjisine dönüşür. Bu sebeple besin için radyasyon oluşması gibi bir durum söz konusu değildir. Ayrıyeten mikrodalga fırınlarda non-iyonize radyasyon bulunduğu için röntgen ışınlarındaki iyonize radyasyon gibi kanser etkisi ve benzeri zararlı etkileri bulunmaz. Zaten günümüzde üretilen mikrodalga fırınlar çok az radyasyon enerjisi üretirler.